茶是世界重要的飲料作物，以迷人的香氣與多種有益健康的多酚化合物而深受廣大消費者的喜愛。然而其滯后的基因組學(xué)研究極大限制了利用分子生物學(xué)技術(shù)進行優(yōu)良性狀的快速選育。隨著第一個茶樹全基因組的測序完成，圍繞茶樹的研究如雨后春筍般相繼涌出，但烏龍茶系列最具代表性的品種“鐵觀音”的基因組圖譜尚未破譯，且茶樹的遺傳和演化歷史仍值得進一步探究。
2021年7月15日，在福建農(nóng)林大學(xué)尤民生教授和張興坦研究員共同主持下，福建農(nóng)林大學(xué)聯(lián)合國內(nèi)外多家單位的科學(xué)家，共同合作，破解了鐵觀音基因組以及茶樹演化史，該論文發(fā)表于國際頂級期刊《自然遺傳學(xué)》（NatureGenetics）。課題組利用獨立開發(fā)的新算法攻克高雜合、高重復(fù)鐵觀音基因組組裝難題，在此基礎(chǔ)上闡述了等位基因不平衡、茶樹群體演化和馴化等相關(guān)科學(xué)問題。
該研究團隊一是利用獨立開發(fā)算法成功攻克高雜合、高重復(fù)鐵觀音基因組組裝難題，拼接了兩套鐵觀音基因組；二是基于鐵觀音分型基因組組裝鑒定到14691個基因具有等位變異，通過分析顯示在無性繁殖的茶樹基因組中，顯性效應(yīng)可能是其應(yīng)對遺傳負(fù)荷的重要機制；三是通過對161個茶樹品種和15個近緣種進行重測序分析等發(fā)現(xiàn)大葉茶與小葉茶存在不同的演化和馴化歷史。
該研究由福建農(nóng)林大學(xué)、深圳基因組所等多家單位合作完成。深圳基因組所張興坦研究員、福建農(nóng)林大學(xué)碩士研究生陳帥、福建省農(nóng)科院水稻所施龍清博士、中國農(nóng)科院煙草研究所龔達平副研究員為論文共同第一作者，福建農(nóng)林大學(xué)尤民生教授、唐海寶教授和深圳基因組所張興坦研究員為共同通訊作者。參與該項目的人員還包括福建農(nóng)林大學(xué)葉乃興、王海峰教授，趙茜、馬曉開博士，研究生張晟鋮、廖振陽、王鵬杰、石巖、王毅斌、余嘉鑫、徐鑫丹、齊睿、王文玲、馬昀然、馬東娜、林京、魏柳鋒、馬亞影、李若愚、何海芳，杭州開泰生物技術(shù)公司詹東亮，加拿大布洛克大學(xué)LietteVasseur教授，福建省農(nóng)科院茶葉研究所孔祥瑞、江西省農(nóng)科院桑茶研究所胡桂萍博士，中南林業(yè)科技大學(xué)張琳教授，美國伊利諾伊大學(xué)香檳校區(qū)RayMing教授，中科院西雙版納熱帶植物園王剛研究員。
